Ο Rachet και Clank είναι υπεύθυνοι για την μεταφορά της επικίνδυνης και διαβόητης Vendra Prog στο Vartax Detention Center. Λόγω διαφόρων επιπλοκών κατά τη μεταφορά αυτή, ο Ratchet δέχεται ένα νέο κύμα επιθέσεων, κάτι που τον αναγκάζει να “ανοίξει δουλειές” και κατ’ επέκταση να ξεκινήσει μια νέα περιπέτεια. Κατά την διάρκεια της ιστορίας θα ταξιδέψετε και στον πλανήτη Yerek όπου και συνεχίζεται η καταδίωξη των κεντρικών κακών της ιστορίας.