Η ιστορία ξεκινάει με την κλοπή του μυστικού βιβλίου της οικογένειας Cooper, το Thievius Raccoonus, και την εξαφάνιση των σελιδών. Ο πιο έξυπνος της παρέας, ο Bentley, καταλαβαίνει ότι οι σελίδες εξαφανίζονται επειδή κάποιος άλλος προσπαθεί να ξαναγράψει την ιστορία με τον δικό του τρόπο. Αμέσως η παρέα ολοκληρώνει την κατασκευή της χρονομηχανής και ο Bentley, o Sly και o Murray ξεκινάνε το ταξίδι στο παρελθόν.